تُثير التحالفات العسكرية لمواجهة الإرهاب تساؤلات متعددة حول مدى فاعليتها في مواجهة التنظيمات الإرهابية في ظل الافتقار إلى تعريف متفق عليه حول الإرهاب واختلال تقاسم أعباء التحالف واختلاف مصالح الدول المتحالفة وخشية بعض الدول من تعرضها لهجمات إرهابية انتقامية.