تمثل التهديدات الإرهابية تحدياً متزايداً للأجهزة الأمنية، وهو ما وضح بصورة خاصة في أعقاب التفجيرات الإرهابية التي شهدتها باريس في يناير ونوفمبر 2015 ، وبروكسل في مارس 2016 ، ويمكن إيجاز أبرز التحديات التي تواجهها أجهزة الاستخبارات في مواجهة الجماعات الإرهابية في النقاط التالية:
